幽冥女王之兄阿達(dá)武士（Rito）加入侵略地球的隊(duì)伍並壓倒性的擊敗金剛戰(zhàn)士摧毀了大連王與戰(zhàn)鬥白虎指揮中心亦在戰(zhàn)鬥中損毀金剛戰(zhàn)士就此失去超異能宙威利用中心所餘的能量將失去超異能的戰(zhàn)士們送去忍者神廟要他們?nèi)ヒ娍裳u造超異能硬幣的忍者戰(zhàn)士（Ninjor）儘管途中有阿達(dá)武士派遣的食人鳥追擊但戰(zhàn)士們依舊成功抵達(dá)神廟獲得新的超異能並多了忍者裝扮的變身型態(tài)以及忍者機(jī)械獸（Ninja Zords）後來巴布猴、怪頭陀與魚匠人等尋獲失落已久的無敵戰(zhàn)將（Shogun Zords）玄冥大帝等人遂奪走小晴的超異能硬幣與大明的戰(zhàn)鬥鷹企圖要脅金剛戰(zhàn)士替自己駕駛無敵戰(zhàn)將征服地球大明只得潛入暗月宮內(nèi)於千鈞一髮之際奪回硬幣與戰(zhàn)鬥鷹而比利亦在操縱無敵戰(zhàn)將時(shí)將控制權(quán)奪來令玄冥大帝的企圖失敗也讓金剛戰(zhàn)士多了五架新的生力軍 小晴為了追求理想決定離開參加體操大賽訓(xùn)練原先遭幽冥女王下咒以企圖謀害金剛戰(zhàn)士的凱特（Katherine）在破除魔咒後取代她成為新的粉紅戰(zhàn)士但過沒多久幽冥女王的父親終極魔王發(fā)動(dòng)魔法將時(shí)間倒轉(zhuǎn)令金剛戰(zhàn)士全回到童年時(shí)期因此失去了超異能為了抵禦侵略宙威自水柔星請(qǐng)來了外星戰(zhàn)士第三季就此進(jìn)入特別篇至於變回兒童的各戰(zhàn)士除了比利透過機(jī)器很快恢復(fù)之外其餘人則到各地尋找奇奧水晶的碎片希望將之收集後發(fā)動(dòng)魔力令地球恢復(fù)原狀而伊莎到非洲尋找水晶時(shí)意外與遠(yuǎn)親相逢從此留在當(dāng)?shù)?由表姊唐娜帶著水晶回到美國但當(dāng)水晶湊齊讓地